文件名称:
ms-microscopy:基于BioID的亚细胞蛋白质定位工具。可从以下站点访问的公开Web版本-源码
开发工具:
文件大小: 1mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-20
详细说明:显微镜
MS显微镜使用完整的亚细胞位置特定参考数据来根据相互作用组实验(例如BioID)数据预测给定诱饵蛋白的定位。
系统要求
MS显微镜不是特定于操作系统的,但仅在Windows 10上进行了测试,并且需要python 3和R 3.5。
python 3.7:
与matplotlib和numpy
R 3.5:
与闪亮和ggplot2
包含的文件
msmicroscopy -directory包含在其中运行msmic.py脚本所需的所有文件以及示例输出。此目录输出目录还包含使用包含的输入文件进行的示例输出。
msmic_online-目录包含在R Shiny中设置ms-microscopy所需的文件。每次运行时,默认情况下都会使用python脚本生成reference_data.csv。
msmic.py的输入文件和参数
training_set_identifiers:此文件包含
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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