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上传时间: 2021-03-20
详细说明：GOOSOS
GOOSOS：从蛋白结构中获取核糖体蛋白
你为什么这么说呢？
问我的朋友亚历克斯T.
怎么发音的？
我知道，一如既往地问重要问题。我的发音就像一个人可能会发音“ Gooses”一样，尽管那不是一个真正的单词。我猜，随它*。
那鹅应该做什么？
给定一组核苷酸Fastas和一组HMM（核糖体或非SCG或其他填充物都可以），此脚本将预测您核苷酸序列的蛋白质序列，从所得的蛋白质Fastas中提取HMM命中值，并将其放入以一定顺序排列，以便您可以对齐它们，然后将它们连接起来进行系统发育分析。
GOOSOS将您提供的HMM压缩到二进制数据库中，然后使用HMMscan搜索预测的蛋白质序列以查找这些HMM的命中。然后我解析所有这些
该脚本产生两个制表符分隔的数据all_hits_evalues_df.tsv样式的输出文件： all_hits_evalues_df.tsv和HITSTAB
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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