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精确逼近算法 关于互补最大条带恢复问题
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文件大小: 479kb
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上传时间: 2018-11-30
详细说明： 基因序列匹配，近似最优算法给定两个基因组图G 1和G 2，每个表示为N序列。 基因标记，最大条带恢复（MSR）问题是保持最大值。 G 1和G 2中标记的数量，使得所得到的子序列，表示 作为G * 一 G·* 2，可以分割成相同长度的最大子串集。 大于或等于二。这样的子串可以发生在反转和否定中。 形式。互补最大条带恢复（CMSR）问题是删除 从G 1和G 2的最小数量的标记用于相同的目的，用它的 基因总最大化的优化目标精确互补 保留在最终最大子串中的标记。MSR和CMSR都是 显示NP-硬和APX硬。MSR的一个4近似算法是已知的。 问题，但没有恒定比近似算法CMSR。在本文中，我们 提出了一种O（3k n 2）时间固定参数可处理算法，其中k是 最优解的大小，以及CMSR问题的一个3逼近算法。
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