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长散布的核元素（LINEs）中的逆转录酶片段的鉴定和表征。
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上传时间: 2020-06-03
详细说明：从异质性，系统发育和染色体分布方面分析了桑树基因组中LINE逆转座子的逆转录酶（rt）片段。 我们使用简并引物对扩增并鉴定了rt的保守域。 序列分析表明rt片段高度异质且富含A / T碱基。 序列同一性为31.8％至99.4％。 基于序列相似性，将rt片段分为八组。 此外，在同一组克隆中，相似的终止密码子分布模式表明它们经历了相似的进化过程。 有趣的是，对从桑树和其他13种植物中分离的rt片段的系统发育分析表明，两个远缘相关的类群（桑树和Pa药Paeonia suffruticosa）组合在一起。 似乎这种现象不是由水平转座因子转移引起的。 荧光原位杂交分析表明，大多数rt片段集中在桑树染色体的亚端和着丝粒附近，但这些元素在桑树基因组中并不丰富。 未来的研究将集中于这些元素在桑树基因组的亚端粒和着丝粒附近的潜在作用。
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