文件名称:
HTMD | 从PDB文件获取3D特征描述符
开发工具:
文件大小: 109kb
下载次数: 0
上传时间: 2020-12-20
详细说明：KDEEP是使用深度学习（CNN）进行亲和力预测的预测器。 关于这篇文章，我发现了一个新的名为HTMD（高通分子动力学）的python库。 我真的不擅长从头算或MD计算等计算领域。 因此，我无法评估该库的实际价值，但我认为它对Comp Chemist很有用。
HTMD可以从Anaconda的acellera通道安装，但要有一些依赖性。 或者可以从github的源代码构建。
感兴趣的功能之一是“Voxel描述符”。 体素表示三维空间中规则网格上的值。 与2D空间中的像素相同。
这意味着HTMD可以从mol文件生成3D描述符。 并且使用该库很容易计算描述符。 HTMD还具有许多操作PDB或SDF
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