文件名称:
DeepGenome:具有大量丢失或冲突信息的基因组数据的分析，集成和质量评估工具。 GapJumper可用于识别可靠的遗传标记，比较大量个体的遗传标记以及使用半监督方法和仅凭经验数据对任何分析中使用的标记进行质量评估-源码
开发工具:
文件大小: 13mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-26
详细说明：GapJumper
灵活的管道，用于整合和不确定性估计从多个样本，重复数据和软件结果中产生的变异调用数据。
跳闸应用
大型和异构数据集中可靠的遗传标记的鉴定
在不同样品，样品组或重复样品中检测到的变异的质量评估
评估通过其他方法获得的结果，例如通过大型筛选研究选择的遗传标记，
基准测试和SNV调用管道开发，
用于序列分析和基因分型的非回归测试，
怎么运行的？
GapJumper是一个开放源代码管道（GNU许可证），它允许集成和分析从多个复制品，示例和软件获得的变体调用数据（请参见下图）。 它允许估计与集成数据中每个核苷酸相关的不确定性，而无需假设每个样品和复制物中的倍性或遗传异质性水平。 分配给每个核苷酸的证据评分仅在经验数据中反映了错误率，缺失数据的数量以及结果的可重复性。
胶粘剂正在解决的主要问题
问题尽管假定它们是相同的，但不同的重复样品，样品，合并的DNA样品或应用于相同样
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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