文件名称:
RegressionAnalysisOfExperimentalData:构造并测试了回归模型,以将稀疏矩阵(<1%)中的数据外推到预测空间的其余部分。 预测变量是嵌入的分子特征,响应变量是实验生物学活动。 包含大量SQL查询
开发工具:
文件大小: 3mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-26
详细说明:实验数据回归分析
准备实验数据的最新数据集非常棘手。 请在ProgressReport.pdf中找到有关如何下载,清理和构建数据的详细信息。 在SQLcommands为文本文件提供所有SQL命令,并根据PDF和下面的说明可以按顺序运行。
数据文件夹中提供了样品处理后的数据,其中包含化学活性(目标变量)和相关的环境信息,包括。 用于以后嵌入的分子(预测变量)。
SQL ChEMBl数据库-激酶蛋白家族的数据清除
寻找具有实验意义的相应实验值
搜索名称中含有激酶的靶蛋白
选择了相应的分析
筛选出200种以下化合物的分析
已删除的活动,没有发布的值,也没有结论性的评论
将pchembl_value更新为其余的published_value为NULL
删除的活动基于standard_units ='%'(140,985)
根据重复的EC50删除了活动
合并相同的重复项
删除了没有pchemb
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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