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CorGO:一种功能相似的基因聚类的综合方法-源码
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上传时间: 2021-03-26
详细说明：哥高
一种功能相似的基因聚类的综合方法
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Pant，N.，Madhumita，M.和Paul，S.CorGO：一种对功能相似的基因进行聚类的集成方法。 跨学科计算生命科学（2021年）。 。
抽象的
共同表达或共同调控的基因组的鉴定对于探索特定疾病（例如癌症）背后的潜在机制至关重要。 研究人员广泛利用从不同平台获得的条件特异性（疾病特异性）基因表达谱，以深入了解疾病的调节机制。 使用基因表达谱开发了几种聚类算法，以识别相似基因的组。 这些算法在计算上是有效的，但是不能捕获基因之间存在的功能相似性，这从生物学角度来看非常重要。 在这项研究中，引入了一种名为CorGO的算法，该算法专门处理功能相似的基因簇的识别。 为此，计算了两种类型的关系。 首先，从基因表达数据中捕获基因之间的相关性（Cor），这有助于根据基因在多个患病样品中的表达来破译基因之间的关系。 其次，利用可用于基因的基于
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