文件名称:
vgrna-project-paper:全转录组学论文中使用的Bash脚本和数据-源码
开发工具:
文件大小: 4mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-26
详细说明：使用剪接的泛基因组图进行单倍体识别的泛转录组分析
该存储库包含脚本，这些脚本用于生成使用剪接的泛基因组图的单倍型泛转录组分析中呈现的结果。
有关如何运行不同方法的更多最新信息，请转到和github页面。 本文中介绍的剪接的全基因组图和全转录组（特定于单倍型的转录本）可从“部分下载，以用于其他项目。
此存储库中有两种类型的脚本：
在文件夹中，我们包括原始脚本和日志文件。 这些文件不是特别用户友好，因为它们包含许多硬编码的路径，但是，出于透明性和可重复性的目的，我们在此处包括了这些文件。 通过查看脚本和日志文件，您可以确切地了解本文中每种方法的运行方式。 大多数日志文件将包含一个短标头，用于指定所使用的Docker映像。 Docker容器可在以下存储库中使用： 。 对于没有此头的日志文件，应从脚本本身中清楚使用了哪个版本。 所有绘图均使用存储库中的R脚本完成。
其余文件夹包括脚本的版
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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