文件名称:
SegmentationLoader:将WSI细分加载到mongodb实例-源码
开发工具:
文件大小: 17kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-26
详细说明:SegmentationLoader
将WSI分段加载到Docker网络环境(即QuIP)中的mongodb实例。
设置
资料夹结构
参见。
./data的目录结构:
├── data/
│ ├── segmentation_results/
| ├── manifest.csv
│ ├── TCGA-A2-A3XZ-01Z-00-DX1.svs/ (folder)
| ├── ...lots of segmented files
|
清单文件将与包含以下文件的目录处于同一级别
清单文件
细分数据是每张幻灯片一个文件夹。 因此,在文件中,您可能具有例如:
segmentdir,studyid,clinicaltrialsubjectid,imageid
TCGA-A2-A3XZ-01Z-00-DX1.svs,TCGA-A2-A3XZ-
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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