文件名称:
DEST-AglyPoolseq:这是DEST存储库的修改版本。 它包含用于映射管道的已修改脚本-源码
开发工具:
文件大小: 359mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-26
详细说明：DEST-AglyPoolseq
修改后的脚本，用于DEST数据集的映射和质量控制。 修改了管道和Dockerfile以与Aphis甘氨酸基因组一起使用。
元数据
populationInfo\ ：具有来自现场和实验室人口的补充数据。
PoolSeq映射管道
mappingPipeline\ ：包含dockerized映射管道。 下载数据，生成bam文件，过滤器文件，gSYNC文件
合并DGN数据
add_DGN_datda\ ：下载，格式化DGN数据，并将其转换为gSYNC格式。 未在该项目中使用。
SNP呼叫
PoolSNP4Sync\ ：基于gSYNC文件的SNP调用SNAPE\ ：基于快照输出的SNP调用
实用程序脚本
utility\ ：（a）下载单个文件； （b）
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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