文件名称:
Hopla:简化的duotrio分析和系谱单倍型-源码
开发工具:
文件大小: 17mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-26
详细说明：霍普拉的目标
Hopla通过研究单个（多样本）vcf文件，最终生成交互式可视化图像，从而使经典的基因组单，二重，三重等分析成为可能。 此外，在可能的情况下，Hopla会通过执行离线谱系单倍型设计。 除了进行产后分析外，它的全包输出可在植入前基因测试期间选择胚胎，从而最终使受影响家庭中的健康儿童分娩。 “ Hopla”这个名字源于既是“单曲”字谜又是受欢迎的儿童电视节目。
输入
（多样本）vcf.gz文件（在我们的测试中，通过bcbio使用gatk-haplotype和gatk-haplotype-joint；设置文件： example / example-bcbio.yaml ）
几个参数参数，例如以和/或命令行参数的形式定义家族谱系结构所需的参数
争论
强制性论点
--vcf.file [string] vcf.gz文件的路径（多样本）
--out.dir [string]输出文件夹
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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