文件名称:
EP-GBDT:EP-GBDT是仅通过使用序列信息来预测必需蛋白质的一种计算方法-源码
开发工具:
文件大小: 18mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-25
详细说明：乙交酯
EP-GBDT是仅通过使用序列信息进行必需蛋白质预测的一种计算方法。
要求
numpy == 1.18.1
scikit学习== 0.23.1
imblearn == 0.7.0
用法
在这个GitHub项目中，我们提供了一个演示以演示EP-GBDT的工作方式。
在Raw data文件夹中，我们提供了原始蛋白质序列及其标签。 您可以将它们用于其他基于序列的必需蛋白质预测。 在“加工的特征”文件夹中，我们提供了通过伪氨基酸组成（PseAAC）工具获得的加工的蛋白质序列特征。 在通过8种中心方法得出的预测结果中，我们提供了原始PPI网络和8种中心方法的结果。 data_h.pkl和data_y.pkl用于分别存储由202010086的随机种子生成的训练集和测试集。 随机种子用于确保您可以产生与本文相同的结果。
在我们的演示中，我们提供了一个python文件（train_main
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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