文件名称:
sagawe:从MDA派生的HiMiSeq（重叠）配对末端Illumina库组装单扩增基因组（SAG）的建议工作流程和随附脚本-Source circle
开发工具:
文件大小: 28kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-25
详细说明：单扩增基因组-组装工作流程示例（SAG-AWE）
该脚本旨在作为建议的工作流程，用于组装和分析从Illumina Hi- / Mi-Seq配对末端文库衍生的测序“单扩增基因组”。
用户可用的选项很少，并且大多数基础程序均设置为其默认值。 目的是一次生产100个SAG的快速粗糙且可重现的组件。
SAG组装工作流程示例图
根据您选择的选项，有四种组装数据的路径。
T（绿色）-饰边
TN（蓝色）-修整并归一化
TM（黄色）-修剪并合并
TNM（紫色）-修剪，标准化和合并
我们建议使用所有三个选项-t，-n和-m来产生“最佳”程序集，但是您的库制备/设计和测序结果可能在不同的选项下效果更好。 如果要进行比较，可以在同一输出目录中使用不同选项运行工作流。
红色箭头表示先前步骤中的数据要求
虚线箭头表示由MultiQC读取的报告
灰色箭头表示将来的添加。
用法/帮助示例
Single Ampl
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
相关说明
- 本站资源为会员上传分享交流与学习,如有侵犯您的权益,请联系我们删除.
- 本站是交换下载平台，提供交流渠道，下载内容来自于网络，除下载问题外，其它问题请自行百度。
- 本站已设置防盗链，请勿用迅雷、QQ旋风等多线程下载软件下载资源，下载后用WinRAR最新版进行解压.
- 如果您发现内容无法下载，请稍后再次尝试；或者到消费记录里找到下载记录反馈给我们.
- 下载后发现下载的内容跟说明不相乎，请到消费记录里找到下载记录反馈给我们，经确认后退回积分.
- 如下载前有疑问，可以通过点击"提供者"的名字，查看对方的联系方式，联系对方咨询.
