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上传时间: 2021-03-22
详细说明:描述
序列分析是生物信息学的主要主题之一。 现有的几个库将生物学序列的表示与精确和近似模式匹配以及比对算法结合在一起。 我们介绍Jstacs,这是一个开放源代码Java库,它专注于生物学序列的统计分析。 Jstacs包含序列数据的有效表示形式,并提供了许多统计模型的实现方式,以及用于参数学习的生成性和判别性方法。 使用Jstacs,可以在测试数据集上或通过评估多种性能指标的交叉验证实验来评估和比较分类器。 由于其严格的面向对象设计,Jstacs易于使用且易于扩展。
有关更多信息,包括API文档,代码示例,常见问题解答,二进制文件和食谱,请访问 。
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Jstacs核心类可以在de.jstacs的子包中找到。 打包项目中包含使用和扩展这些核心类以用于特定应用程序的单个项目。
可从获得基于Jstacs的项目列表,包括用户参数的二进制文件。
基于Jstacs的可视化参数并生成基于
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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