文件名称:
ngs_scripts:我经常使用的脚本-源码
开发工具:
文件大小: 13kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-21
详细说明：ngs_scripts
我经常使用的ngs脚本的存储库。
脚本清单
align_RAD_2019.sh =对齐R1和R2 fastq文件中的RAD数据（markdup，fixmate）
align_ind_fa_2019.sh =单个fastq文件中数据的基本对齐
Barcodes_pst1.csv =用逗号分隔的Pst1条码列表
Barcodes_sbf1.csv-Sbf1条码的逗号分隔列表
BarcodeSplitList3Files.pl = Perl脚本，用于根据给定的条形码拆分通道
BCsplitBestRadPE2.pl = perl脚本，用于通过内嵌条形码按Kong划分每个泳道。注意：现在需要在行中提供条形码-确保条形码与RE相匹配
BUSCOv？.sh =运行BUSCO版本x的脚本
RUN_alignment_RAD.slurm =要提交以对齐RAD PE数据的Slurm
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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