文件名称:
archer:在运行CLIMB工作流程之前对扩增子数据进行预处理-源码
开发工具:
文件大小: 77kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-21
详细说明:射手
用于分类,珩磨和导出读段的Artic资源
关于
这是一个基本的微服务,用于在运行CLIMB工作流程之前对数据进行预处理。它具有一个gRPC API,该API支持启动/取消/监视示例处理任务,并包括一个用于运行服务器和客户端实现的命令行应用程序(称为archer )。
如果用户希望CLIMB对数据运行,则需要在CLIMB处理数据之前在本地检查数据并将其上传到S3存储桶。这是archer进来的地方。它将:
验证ProcessRequest提供的样本以获取最少的元数据
针对扩增子引物方案的与样品链接的过滤器读数
压缩所有目标读取并上传到S3
报告回来
依存关系
除了列出的外部Go软件包,还需要以下工具和软件包来构建微服务可执行文件和文档:
制作
转到工具链
协议
原协议
原始文件
正在安装
易于安装由处理:
make all
该命令将:
编译Go的原始文件
编译gRPC API文档
在G
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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