文件名称:
ml-course-project:医学生物信息学2020课程的机器学习项目工作-源码
开发工具:
文件大小: 42mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-21
详细说明：毫升课程计划
用于2020年医学生物信息学机器学习个别课程项目分配的回购协议。
描述
在此项目中，目标是将各种机器学习（ML）方法应用于选择的数据集并评估其性能。当我在博士学位研究中使用空间转录组学（ST）时，我决定将此类数据集用于该项目。该工作量应相当于大约一个星期的工作。
在此项目中，我选择将ML应用于一组乳腺癌ST数据集，其中每个数据点（“斑点”）均被标注为癌症或健康，并使用ML来查看是否可以仅使用ML来预测这些标签基因表达数据。
代码
使用Jupyter Notebook的Python 3中的所有代码以及ML方法均来自scikit-learn。为此项目设置了一个envirronment.yml环境，可以使用envirronment.yml文件安装该环境。
数据
我获得了在我们研究小组（ ）中产生的数据的访问权限，其中包含来自乳腺癌组织切片的几个ST数据集。数据是Alma Ande
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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