文件名称:
multitax:Pyhton库提供了一个通用接口来获取，解析和与生物分类法进行交互（GTDB，NCBI，Silva，Open Tree分类法，Greengenes，“ Custom”）-源码
开发工具:
文件大小: 11kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-20
详细说明：多重税
Pyhton库提供了一个通用的接口来获取，解析和与生物分类法（GTDB，NCBI，Silva，Greengenes，Open Tree分类法）进行交互+“ Custom”和“ Empty”分类法。
目标
快速，直观，通用且易于使用
启用使用不同分类法的多种工具进行的分析
启用工具和脚本以轻松扩展与多个分类法的兼容性，而无需额外的实施工作
用法
# GTDB
from multitax.gtdbtx import GtdbTx
# Parse local files
tax = GtdbTx(files=["bac120_taxonomy.tsv.gz", "ar122_taxonomy.tsv.gz"])
# tax = GtdbTx() # Download and parse files on the fly
# tax = GtdbTx(output_prefix="my/p
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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