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下载次数: 0
上传时间: 2021-03-20
详细说明:InterCom-重建功能性单元间通信网络
重建给定单细胞RNA-seq数据集的功能性细胞间通信网络。
所需软件
R v3.5或更高
文字形状v1.6.0
ggplot2 v 3.3.0
stuRpkg v1.3
dplyr v0.8.5
doParallel v1.0.15
斯金格v1.4.0
plyr 1.8.6
igraph v1.2.5
矩阵v1.2-18
重塑2 v1.4.4
RSpectra v0.16-0
雪v0.4-3
taRifx v1.0.6.2
gtools v3.8.2
data.table v1.12.8
利斯特v0.4.6.1
运行对讲机
加载库后,可以通过单个命令调用完整的InterCom工作流程。
InterCom( data ,
anno.tbl ,
species ,
sigho
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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