文件名称:
pooled-cell-painting-profiling-recipe:配方存储库，用于基于图像的池化细胞绘画实验分析-源码
开发工具:
文件大小: 144kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-19
详细说明：合并单元格绘画-基于图像的分析管道配方 :woman::cooking: :man::cooking:
汇总单元绘画数据的分步数据处理管道。
原料
数据是科学的主要成分。在这里，我们的数据来自“合并细胞绘画”实验。
在这些实验中，数据是数千个.csv文件，这些文件存储了来自数百万个单细胞的元数据和形态学测量结果。
数据成分有两种基本类型：
细胞
斑点
Cells成分代表每个分割的单个细胞的各个细胞区室的形态学测量值。 Spots成分代表用于“细胞呼叫”的原位测序（ISS）结果。细胞呼叫是使用ISS在细胞Spots内读取的条形码序列，将特定CRISPR扰动分配给单个细胞的过程。因为实验是“汇集的”，所以单个Kong中存在成千上万的CRISPR条码。
目前，这两种数据成分的测量都是由CellProfiler软件进行的（使用定制的Pooled Cell Painting插件）。
配方步骤
所有食谱还包括针对每个食谱的特定说明或步骤。
我们的食谱
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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