文件名称:
SpongeModule:预测miRNA海绵模块的计算机方法-源码
开发工具:
文件大小: 1mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-19
详细说明：海绵模块
介绍
预测竞争性内源性RNA（ceRNA）或microRNA（miRNA）海绵模块是揭示模块一级ceRNA调控机制的挑战和有意义的任务。在此背景下的模块代表相互竞争的miRNA海绵组，它们容易成为实现生物学过程的功能单元。现有的用于识别miRNA海绵模块的计算机方法可分为三种类型：（i）基于网络的聚类，（ii）矩阵分解和（iii）逐步评估。
五个代表性模块发现方法进行比较
-基于网络的群集：SC + MCL，SPONGE + MCL
-矩阵分解：CeModule，LAceModule
-逐步评估：LMSM
五个代表性模块发现方法的用法
将包括脚本和数据集在内的所有文件粘贴到一个文件夹中（将该文件夹设置为Matlab和R环境的目录），在“脚本”文件夹中实现了五种代表性模块发现方法的脚本。注意，某些脚本在Matlab上运行，而某些脚本在R上运行。例如，用户可以使用LMSM方法简单
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
相关说明
- 本站资源为会员上传分享交流与学习,如有侵犯您的权益,请联系我们删除.
- 本站是交换下载平台，提供交流渠道，下载内容来自于网络，除下载问题外，其它问题请自行百度。
- 本站已设置防盗链，请勿用迅雷、QQ旋风等多线程下载软件下载资源，下载后用WinRAR最新版进行解压.
- 如果您发现内容无法下载，请稍后再次尝试；或者到消费记录里找到下载记录反馈给我们.
- 下载后发现下载的内容跟说明不相乎，请到消费记录里找到下载记录反馈给我们，经确认后退回积分.
- 如下载前有疑问，可以通过点击"提供者"的名字，查看对方的联系方式，联系对方咨询.
