文件名称:
VoCreportGenerator:从mergeQCresults_plusMissing的输出生成VoC报告(按run#表示正,可能按run#表示,以及变体请求(yesno状态,添加了VoC类型)(假设将其移至PC,并在末尾为Run#I
开发工具:
文件大小: 7kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-19
详细说明:VoCreportGenerator
生成VoC报告(按运行号为正,按运行号可能为正,以及变体请求(是/否/可能/失败状态,VoC类型(例如英国(B.1.1.7),南非(B.1.351),巴西(P .1),尼日利亚语(B.1.525),不是VoC,可能是[从ncov监视列表ID中的Voc],WGS QC失败)从mergeQCresults_plusMissing的输出中添加(假设您将其移至PC,并在末尾添加了额外的列用于运行编号/ ID)。
假设:
我们使用以下管线来产生以下结果:BCCDC-PHL / ncov2019-artic-nf(从connor-lab / ncov2019-artic-nf分叉)和BCCDC-PHL / ncov-tools(从jts / ncov-tools分叉)
您应该在网络/ PC上设置以下文件夹(或更改脚本中的路径以反映要保存VoC表/报告的位置):
在
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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