文件名称:
ocean:R包用于代谢酶富集分析-源码
开发工具:
文件大小: 9mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-19
详细说明：海洋
R包用于代谢酶富集分析
概述
代谢组学数据集所包含的功能洞察力目前尚未得到充分利用。这部分是由于代谢React网络的复杂性以及React通量和代谢物丰度之间的间接关系。然而，基于足迹的方法已经在数十种其他眼科数据集（如转录组和磷酸化蛋白质组学）的背景下可用。在这里，我们介绍ocEAn，该方法可从recon2React网络的简化精简版本中定义代谢酶的足迹，并以与激酶底物相同的方式，使用它们来探索代谢物丰度相对于代谢酶的相对位置的协调失调。和TF-targets富集分析。
教程
安装软件包（从github使用devtools）：
# # If needed instal devtool package
install.packages( " devtools " )
# # instal COSMOS
library( devtools )
install_github( " saez
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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