开发工具:
文件大小: 15mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-19
详细说明：GATK-SV
用于Illumina短读全基因组测序（WGS）数据的结构变异发现管道。
目录
原始呼叫者和证据收集
批量质量控制
-gCNV模型创建
批量证据合并，BAF生成和深度调用者
网站集群
网站指标
过滤
跨批次站点合并
基因分型
基因型优化（可选）
跨批次集成，复杂事件解决和VCF清理
下游过滤
注释
质量控制和可视化
附加模块-Mosaic和de novo
部署和执行：
一个帐户。
支持（WDL）的流执行系统，可以：
（v36或更高版本）。强烈建议使用专用服务器。
或 （请注意，此平台尚不支持预配置的GATK-SV工作流程）
推荐： 。由于许可限制，我们无法为此算法提供公共docker映像或参考面板VCF。
推荐：用于与专用Cromwell服务器进行交互的 。
推荐：用于验证WDL / json文件的 。
数据：
Illumina短读全基因组CRAM或BAM，与带有hg38
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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