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上传时间: 2021-03-19
详细说明:OmicNavigator:用于Omic数据分析和可视化的开源软件
通过交互式Web应用程序探索眼科分析的结果可促进跨学科的协作和生物学发现。 OmicNavigator是用于对高通量生物学实验结果进行存档和交互式探索的开源软件。该软件使omic数据分析人员(通常是生物信息学家)仅使用统计编程语言R就可以根据其工作结果创建可自定义的Web应用程序。OmicNavigator捆绑为一个R包,其中包含Web应用程序代码,用于程序访问和数据的R函数沉积物,以及用于存储测量值(例如RNAseq读取计数),统计分析(差异表达和/或富集分析),元数据和自定义绘图功能的新容器。用OmicNavigator创建的研究本身就是R包,可以通过JavaScript仪表板进行访问,可以在用户的本地计算机上对其进行查询,也可以将其在线部署以供协作者浏览。仪表板将用户定义的研究结果和特征图与生物信息学分析常用的性
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