文件名称:
Computational-Genomics:计算基因组学的Java智能项目,其中包含-源码
开发工具:
文件大小: 11kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-19
详细说明:计算基因组学软件
计算基因组学Java项目,其中包括:成对序列比对,系统发生和多序列比对。
成对序列比对
计算两个序列(DNA,RNA或蛋白质)的成对序列比对的程序。
•输入(用于输入参数的简单GUI):
两个序列的文本字段(允许的字符az和AZ)
带有替换矩阵值的字段。例如:匹配2不匹配-1 indel -1.5间隙0•单选按钮以选择对齐算法:o整体对齐o末端空间自由对齐o局部对齐o仿射间隙罚分模型对齐•按钮以启动算法。
•输出(带有对齐输出的GUI窗口)o成对对齐,显示所有匹配项,子项和插入/缺失。 o比对得分,匹配数,替换和插入缺失。
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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