文件名称:
DNAPacManHMM:吃豆人如何预测蛋白质-源码
开发工具:
文件大小: 93kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-19
详细说明：DNAPacManHMM
DNA吃豆人游戏（ ）可以代表如何生成蛋白质序列（使用隐马尔可夫模型）。我们可以类比HMM在使用Pac-Man生成蛋白质序列的背景下如何工作。您吃的下一个标记/字母是生成蛋白质氨基酸序列的序列中的下一个字母。
本质上，如果我们组织吃豆人板中代表马尔可夫模型中不同隐藏状态的区域，那么吃豆人吃的下一个字母可以代表HMM选择的下一个状态。我们可以更改某个字母可能出现的概率，并且当吃豆人进入隐藏状态时，该概率将发生变化。
我们可以观察人们根据下一个选择的字母，随着人们演奏不同状态的概率如何变化。我们可以按照此手稿“隐马尔可夫模型及其在生物序列分析中的应用”的方法，将Pac-Man的HMM与真核基因建模中的HMM进行比较： :
什么是HMM？
HMM是用于对一维离散符号数据建模的统计表示方法。我们可以用它们来描述取决于内部不可观察因素的可观察事件如何随时间演变。
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