文件名称:
optimal_sensors:与“用于设计生物报告器的最佳报告子位置”有关的代码和数据-源码
开发工具:
文件大小: 164mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-19
详细说明：学习Koopman运算符以从两个条件的时序基因表达设计记者
重要提示：应及时对基因表达时间序列进行均匀采样。如果您想对异类采样数据应用类似的方法，请告诉我，我也许可以帮助将Koopman运算符模型替换为Koopman生成器模型，从而实现下游可观察性最大化。
main.py
必需的输入：包含压缩的pickle（.gz）文件的数据目录（变量datadir）。该文件包含以下列表：[背景减去基因表达动态的3个张量（即$ maximum（处理-对照，0.0）$），其中第1个暗样本，第2个暗时间，第3个暗复制，基因标识符数据集，与数据集相对应的行索引（此处是因为输入数据集可能不是整个数据集），以整数形式显示的时间点列表（例如，如果输入数据集仅包含第2和第4个时间点，则它将为[1， 3]）]。
脚本中有一些标志，用于保存结果，在两种方法中进行参数推断/模型选择（动态模式分解（精确或简化）和深度动态模式
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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