文件名称:
scGEAToolbox:scGEAToolbox-源码
开发工具:
文件大小: 202mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-19
详细说明：scGEAToolbox-用于单细胞RNA序列数据分析的Matlab工具箱
介绍
动机：单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术彻底改变了生物医学科学领域的研究方法。它为研究细胞异质性和基因表达变异性提供了单个细胞前所未有的分辨率。由于数据的稀疏性和高维性，因此分析scRNA-seq数据具有挑战性。结果：我开发了scGEAToolbox —一种用于scRNA-seq数据分析的Matlab工具箱。它包含用于数据归一化，功能选择，批处理校正，插补，单元格聚类，轨迹/伪时间分析和网络构建的一整套功能，这些功能可以组合并集成以构建自定义工作流程。虽然大多数功能是在本机Matlab中实现的，但提供了包装器功能，使用户可以调用以Matlab或其他语言开发的“第三方”工具。此外，scGEAToolbox配备了由App Designer生成的复杂的图形用户界面（GUI），使其成为易于使用的应用程序，可以
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