文件名称:
CAISC:CAISC（具有SNV和CNV集成的克隆体系结构）-源码
开发工具:
文件大小: 1mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-18
详细说明：CAISC（存储库将在2021年4月1日之前完全更新）
CAISC代表具有SNV和CNV集成的克隆体系结构，是一种软件，该软件集成了拷贝数变异和单核苷酸突变，可通过单细胞RNA测序进行遗传异质性分析和亚克隆检测
手稿
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安装
管道
我们提出了具有SNV和CNV集成的克隆体系结构（CAISC），这是一种新的子克隆检测算法，该算法集成了SNV和CNV数据以获取更准确和更强大的聚类结果。这是CAISC管道的概述，将在下一张幻灯片中详细介绍。我们分别使用SNV和CNV数据，分别从DENDRO和infercnv得出两个细胞间距离矩阵。使用熵加权方法将这些矩阵集成到最终距离矩阵中，该最终距离矩阵用于将细胞聚类为亚克隆。
概述
图1.具有SNV和CNV集成的克隆体系结构（CAISC）。集
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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