文件名称:
briscoe-nf-tobias:Tobias分析工具的Nextflow包装器-源码
开发工具:
文件大小: 44kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-18
详细说明:布里斯科-nf-托比亚斯
Joaquinas的分析管道与Tobias分析工具一起使用
管道轮廓
管道运行的不同步骤。有关每个步骤的详细说明,请访问其 。
给定一个设计文件,一个主题文件和映射文件(bam格式),它将在所有条件下运行TOBIAS的ATACorrect,ScoreBigwig,BINDetect,并且将为文件中的每个主题生成经过校正插入的PlotAggregate元图。
用法
可以在以下示例中运行管道:
nextflow run luslab/briscoe-nf-tobias \
-r master \
-profile crick \
--genome genome.fa \
--regions regions.bed \
--peaks regions.bed \
--blacklist blacklist.bed \
--motifs mo
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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