文件名称:
BinMat:一个R Shiny应用程序,用于处理来自片段分析方法(例如ISSR和AFLP)的二进制数据-源码
开发工具:
文件大小: 57kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-18
详细说明:BINMAT:用于片段分析数据
用户指南
由...制作:克拉克·范·史丹顿(Clarke van Steenderen)动物学与昆虫学系南非东开普省格雷厄姆斯敦罗德大学电子邮件:
概述
编写该程序是为了快速整合源自显性标记遗传分析(例如,用于简单序列间重复(ISSR)和扩增片段长度多态性(AFLP)的二元矩阵)。这可以应用于由重复对组成的数据,也可以用于合并整个数据集(即,将所有上载的样品视为一个样品的重复样品)。用户还能够生成交互式非度量MDS图,并根据指定的最小峰值阈值过滤其数据。
安装R包
BinMat在CRAN上可用,可以使用以下命令进行安装:
install.packages("BinMat")
或者可以通过GitHub作为R Shiny应用程序运行:
install.packages("shiny") library(shiny) shiny::runGitHub("Bin
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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