开发工具:
文件大小: 31kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-18
详细说明：程序
高通量自动化组装流程
软件依赖
cd-est-est 4.6.4
命中0.7
天鹅绒1.2.10
phrap / cross_match 1.090518
seqtk 1.3（r106）
Python模块：PyYaml
数据格式要求
原始双端文件：条形码样本的序列已清除条形码，序列文件不分割，条形码标注在序列注释最后，用：分割
SeqID [描述]：条形码
可自行对fastqReader.py中的_read_one_record方法修改条形码的识别方式
配置文件说明
config配置文件示例：config.yml格式为YAML格式，'：'号后留一个空格
# 双端文件，fastq格式，支持gz压缩
FW_file: /home/vet/public/opt/data/PARFuMS/datasets/1.clean.fastq.gz
RC_file: /home/vet/pub
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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