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文件大小: 2mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-18
详细说明：指标-CGM-ECC
合并了两个单独项目的工作（可以在以下位置找到初始合并之前的状态： : 和 ）
要收集结果，请在终端中运行以下命令：
Rscript环境_设置.R
这将安装环境中未找到的所有必需的R软件包，并检查是否可以正确加载它们。它还会将占位符源距离文件写入input / processed /目录，如果您有要使用的源数据，则可以覆盖该占位符。
如果对样本数据运行此过程，请运行
Rscript prepare_inputs.R
否则，将您（正确格式化的）输入文件移动到inputs / processed /目录中。要运行以下文件，需要使用4个制表符分隔的文件：时间点1的群集分配文件，时间点2的群集分配文件，应变元数据文件和源距离文件（如果未提供，将使用占位符）。
如果使用了示例数据，并且运行了prepare_inputs.R ，您将获得以下示例中使用的文件。
Rscript
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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