文件名称:
bamcov:快速计算和可视化比对文件中的序列覆盖率-源码
开发工具:
文件大小: 265kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-18
详细说明:┌┐ ┌─┐┌┬┐┌─┐┌─┐┬ ┬ Quick calculation and visualization
├┴┐├─┤││││ │ │└┐┌┘ of sequence coverage on the terminal
└─┘┴ ┴┴ ┴└─┘└─┘ └┘ v0.1
安装
git clone --recurse-submodules https://github.com/fbreitwieser/bamcov
cd bamcov
make
make test
确保使用--recurse-submodules克隆存储库以获取htslib,否则必须在克隆的存储库中键入git submodule update --init --recursive 。
用法
显示带有标题的表格输出(默认):
./bamcov -H test.ba
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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