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上传时间: 2021-03-18
详细说明：用于“酵母菌种之间耐热变异的种群和比较遗传学”的脚本
G1绘图：
G1_ESP1_plotting.ipynb：生成图1的图（在ESP1 5'端的酿酒酵母种群中，高等位基因频率的峰值）。
G1_pi_plotting.ipynb：生成补充图1的图（葡萄酒/欧洲酿酒酵母在耐热基因上共享的等位基因的空间分布）。
麦当劳-克赖特曼：
MK_calc.ipynb：使用Biopython库运行McDonald-Krietman测试，并输出MK p值和统计信息（Dn，Ds，Pn，Ps）。
MK_analysis.ipynb：重采样MK_calc.ipynb中生成的McDonald Kreitman统计信息。
Dxy：
dxy_calc.py：为目录中的每个文件计算Dxy。
dxy_analysis_1011pops_EuroSpar.ipynb：使用重采样测试来计算酿酒酵母种群（Pet
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