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ABC_TimeAdapt:TimeAdapt对人口统计学和从纵向种群基因组数据中进行选择进行了联合推断。该推论基于通过随机森林的近似贝叶斯计算。它需要整个基因组数据和有关样品年龄的信息来进行模拟（使用SLiM + pyslimmsprim
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文件大小: 52kb
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上传时间: 2021-03-18
详细说明：时间适应
TimeAdapt对人口统计学和从纵向种群基因组数据中进行选择进行了联合推断。该推论基于通过随机森林的近似贝叶斯计算。它需要整个基因组数据和有关样品年龄的信息来进行模拟（使用SLiM + pyslim / msprime）。
要求
该代码已经过以下版本的测试：
的Python 3.8.5
scikit-allel 1.3.2
argparse
msprime 0.7.4
麻木
pyslim 0.403
scipy 1.5.4
R 3.6.1
argparser 0.6
extraDistr 1.8.11
碳1.3.1
SLiM 3.4
使用conda进行配置
从头开始创建环境：
$ conda create -n timeadaptenv python==3.8.5 r-base=3.6.1
$ conda activate timeadaptenv
$ pip
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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