文件名称:
Covid_TA_cellxgene_install:COVID TA项目的安装说明-源码
开发工具:
文件大小: 1kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-18
详细说明:Covid_TA_cellxgene_install
COVID TA项目的安装说明
根据Angela Pisco的教程建模: :
Cellxgene文档以供参考: ://chanzuckerberg.github.io/cellxgene/posts/install
确保您的计算机上装有Google Chrome浏览器
假设您在干净的MacOS环境中工作:
1.安装Anaconda
下载: :
安装说明: :
2.打开终端
Spotlight搜索(命令+空格键):终端
3.检查python版本是3.8
python --version
4.安装python依赖项
点安装scanpy
pip install louvain
5.安装cellxgene
点安装cellxgene
6.下载h5ad文件(以冒号/回肠为例):
将.h5ad文件保存到您选择的文件夹
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
相关说明
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