文件名称:
3DFI:3DFI管道预测蛋白质的3D结构并在3D空间中搜索结构同源性-源码
开发工具:
文件大小: 264kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-17
详细说明：3DFI管道预测蛋白质的3D结构，然后在3D空间中搜索结构同源性。 使用来自程序包的GESAMT（大分子靶的一般有效结构比对）的本地副本数据库搜索PDB格式预测的结构。 还可以针对一组预测结构搜索已知的PDB结构，以识别预测数据集中潜在的结构同源物。
目录
介绍
关于功能推论
使用计算方法推断蛋白质的功能通常涉及基于序列或结构进行某种同源性搜索。 在基于序列的搜索中，使用诸如 ， ， 或工具针对已知的蛋白质或基序查询核苷酸或氨基酸序列，但如果所研究的蛋白质差异很大，这些搜索可能会失败。 在基于结构的搜索中，将在3D级别搜索蛋白质，以获取结构同源物。
为什么是结构同源物？
因为结构通常在生物学中具有功能，所以结构同源物通常也具有相似的功能，即使构件不一样（即，由木头或钢制成的轮子仍然是轮子，无论其组成如何）。 使用这种方法，假设可以进行结构匹配，我们也许能够推断出在序列水平上与已知蛋白质
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