文件名称:
NetworkInference.jl:从数据推断无向网络的方法-源码
开发工具:
文件大小: 29kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-17
详细说明：网络推断
描述
NetworkInference是一个用于推断（非定向）网络的程序包，其中为每个节点提供了一组测量值。 主要输出是InferredNetwork类型，它表示完全连接的加权网络，其中边缘的权重表示真实网络中存在的边缘的相对置信度。 另请参阅。
注意事项：
该软件包最初是为使用基因表达数据来推断生物网络而编写的，因此使用“网络”而不是“图形”。 但是，这些方法可以应用于其他类型的数据。
当前实现了四种网络推理算法（MI，CLR，PUC和PIDC，在），但我们计划包括更多的算法。
假定网络是无向的，因为到目前为止所包括的所有算法都推断出无向的网络。 因此：
在Edge类型中，节点的顺序是任意的
将网络写入文件时，会在两个方向上写入边，因为下游分析有时需要这样做
InferredNetwork类型包含边的列表，每对基因都有一个边，其中基因的顺序是任意的
安装
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