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上传时间: 2021-03-17
详细说明：二价基因是在同一区域同时标记有H3K4me3和H3K27me3表观遗传修饰的基因，并被提议在胚胎干（ES）细胞中发挥与多能性有关的关键作用。 鉴定这些二价基因并了解其功能对于进一步研究谱系规格和胚胎发育很重要。 到目前为止，在小鼠和人类ES细胞中产生了许多全基因组组蛋白修饰数据。 这些有价值的数据使得鉴定二价基因成为可能，但是目前尚无用于二价基因的综合数据存储库或分析工具。 在这项工作中，我们开发了BGDB，即二价基因的数据库。 该数据库包含人类和小鼠ES细胞中的6897个二价基因，这些基因是从科学文献中手动收集的。 每个条目均包含精选信息，包括基因组背景，序列，基因本体论和其他相关信息。 BGDB数据库的Web服务是用PHP + MySQL + JavaScript实现的，并提供了多种查询功能。
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