文件名称:
WGSpipe-nf:WGSWES数据分析的简便快捷管道-源码
开发工具:
文件大小: 21kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-17
详细说明:WGSpipe-nf
用于WGS / WES数据分析的简便快捷管道
快速开始
-STEP01:-为管道安装下一个流程:
curl -s https://get.nextflow.io | bash OR INSTALL WITH CONDA : conda install nextflow
-该管道基于一个nextflow DSL2,因此您可以运行nextflow自更新以将NEXTFLOW更新为新版本
-STEP02:-CONDA环境部署(可选):要求(fastqc,fastp,multiqc,bwa,gatk,annovar,samtools)
conda env create -f environment.yaml
-此代码将为wgs / wes分析创建一个名为wgs-nf的conda环境
-STEP03:-GIT克隆管道
git clone https://github.
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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