文件名称:
Discount:在Apache Spark上进行分布式k-mer计数和最小化器分析-源码
开发工具:
文件大小: 1mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-17
详细说明:内容
概述
Discount是一个基于Spark的工具,用于k-mer计数和最小化器顺序分析。 它能够分析大型宏基因组规模的数据集,而占用的内存却很小。
该软件包括UF Petrillo等[1]的 。 我们还包括了由 [2]生成的紧凑型通用击中集。
有关详细的背景和说明,请参阅[3]的论文。
基本
是可选的。 如果您不想自己编译Discount,则可以从“页面下载预构建的版本。
跑步折扣
Spark应用程序(例如Discount)可以在笔记本电脑,群集或云中本地运行。 在Google Cloud中,我们已经在Dataproc映像版本1.4(Debian 9,Hadoop 2.9,Spark 2.4)上进行了测试。 但是,Discount应该在可以运行Spark和Hadoop任何平台上运行。
要在本地运行,请首先安装并配置Spark( )。 Discount已在带有Scala 2.1
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
相关说明
- 本站资源为会员上传分享交流与学习,如有侵犯您的权益,请联系我们删除.
- 本站是交换下载平台,提供交流渠道,下载内容来自于网络,除下载问题外,其它问题请自行百度。
- 本站已设置防盗链,请勿用迅雷、QQ旋风等多线程下载软件下载资源,下载后用WinRAR最新版进行解压.
- 如果您发现内容无法下载,请稍后再次尝试;或者到消费记录里找到下载记录反馈给我们.
- 下载后发现下载的内容跟说明不相乎,请到消费记录里找到下载记录反馈给我们,经确认后退回积分.
- 如下载前有疑问,可以通过点击"提供者"的名字,查看对方的联系方式,联系对方咨询.