开发工具:
文件大小: 2kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-17
详细说明：rna_seq
概述：
使用和进行比对的RNA-Seq管线（如果是后者则为伪比对）。
参数：
-a | --aligner-to-use -a | --aligner-to-use ：如果要使用Kallisto，则指定1如果要使用HISAT2，则指定2 。 默认值：Kallisto -i | --input-files-directory -i | --input-files-directory ：输入包含FASTQ文件的目录的路径。 -r | --reference-index -r | --reference-index ：输入参考索引的路径。 1.如果选择了Kallisto，则输入索引参考转录组的路径（以.idx结尾）； 2.如果选择了HISAT2，则输入带前缀的索引参考基因组的路径-o | --output-directory -o | --output-directory ：
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