文件名称:
tourmaline:使用QIIME 2和Snakemake进行扩增子序列处理的工作流程-源码
开发工具:
文件大小: 4mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-17
详细说明：电气石
电气石是使用及其包装的软件包对Illumina序列数据进行的扩增子序列处理工作流程。 电气石使用工作流程管理系统管理命令，输入和输出。
为什么要使用电气石？
电气石具有增强可用性和互操作性的若干功能：
可移植性。 除Docker容器外，对Linux和macOS的本机支持。
QIIME2。电气石的核心命令（包括软件包）都是QIIME 2的命令，QIIME 2是最流行的扩增子序列分析软件工具之一。 您可以在运行工作流程之前或同时打印工作流程的所有QIIME 2和其他Shell命令。
Snakemake。 使用Snakemake管理工作流有以下好处：
配置文件将所有参数包含在一个文件中，因此您可以查看工作流程在做什么，并为以后的运行进行更改。
每次电气石运行的目录结构都是相同的，因此您始终知道输出的位置。
按需命令意味着仅运行尚未生成的输出文件所需的命令，从而在重新运行工作
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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