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文件大小: 8mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-16
详细说明:DE-nf:管道V1.0
在流水线下一步处理中,分析整体表达的差异性RNAseq。
描述
FASTA issus deséquençageNGS的RNAseq补全品和分析产品的流水线。
媒体报导:
STAR重新定位(选项)。
Alignement des通过STAR朗读法语课程。
通过htseq-count交叉路口的SAM sur l'annotation deréférence。
Élaborationde la matrice finale de compcomp蛮力。
通过DESeq2软件包(选项框)分析R的表达差异。
Veuillez顾问“使用”浇注测试仪,位于管道系统中。
依赖关系
Linux上的流水线函数发行版。
继续使用Nextflow的管道基础。 先进的和设备使用前管道的高级保护要求。
安装软件:
STAR(版本2.7.7a)
samtools(1.9
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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