文件名称:
bioruby-polymarker:PolyMarker的Web界面-源码
开发工具:
文件大小: 825kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-16
详细说明:PolyMarker
这是一个便于使用PolyMarker的服务器。
系统依赖
该服务器是使用rails 5.1上的ruby 2.4开发的。 其他版本也可以使用,但未经测试。 PolyMarker已在MacOS X和Linux(Ubuntu)上进行了测试。 PolyMarker使用sidekiq排队,这也取决于redis 。
您需要安装ncbi-blast 。
设置服务器。
首先要做的是加载不同的引用
rake reference:add[references.yml]
该文件的格式为yaml 。 它可以包含具有以下字段的多个引用:
名字。 将在服务器中显示的名称
路径。 带有参考的未压缩fasta文件的完整路径。 辉光和爆炸指数将在该路径上生成。
基因组计数。 参考文献中的基因组数量:四倍体为1,四倍体为2,等等。
arm_description在polymarker中用于
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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