文件名称:
phyloweb:Web应用程序，使用登录号作为输入并使用RAxML进行树推断来推断系统树-源码
开发工具:
文件大小: 464kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-16
详细说明：Phyloweb
Phyloweb是一个Web应用程序，用于基于登录号创建系统发育树。 这分3个步骤执行：
使用Entrez从NCBI服务器检索序列
使用Clustal Omega或MAFFT进行多序列比对
使用RAxML推断系统树
先决条件：
Python 3.x
conda
设定说明
为了设置应用程序，您需要安装conda。
使用以下方法创建环境：
conda create -n phyloweb -c conda-forge -c bioconda snakemake python=3.8.3 -y
conda activate phyloweb
创建并激活后，运行install.sh脚本
chmod +x install.sh
./install.sh
最后，使用以下命令运行该应用程序：
flask run
该应用程序将在端口5000（ ）的本地主机上提供。
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
相关说明
- 本站资源为会员上传分享交流与学习,如有侵犯您的权益,请联系我们删除.
- 本站是交换下载平台，提供交流渠道，下载内容来自于网络，除下载问题外，其它问题请自行百度。
- 本站已设置防盗链，请勿用迅雷、QQ旋风等多线程下载软件下载资源，下载后用WinRAR最新版进行解压.
- 如果您发现内容无法下载，请稍后再次尝试；或者到消费记录里找到下载记录反馈给我们.
- 下载后发现下载的内容跟说明不相乎，请到消费记录里找到下载记录反馈给我们，经确认后退回积分.
- 如下载前有疑问，可以通过点击"提供者"的名字，查看对方的联系方式，联系对方咨询.
