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搜索资源列表

  1. 使用Visual Studio Team Foundation Server进行团队开发

  2. 本书共分四部分，此为第一部分包括基础知识、源代码管理、生成、大型项目考虑事项项目管理、过程指南、报告、设置和维护团队环境和Visual Studio 2008 Team Foundation Server等九章节Jeff Beehler 撰序序言发布 Microsoft® Visual Studio® 2005 Team Foundation Server (TFS) 之前，我们自己先进行了一次尝试——使用它来开发 TFS。在项目的最后 18 个月中，我们尽可能地应用它来管理项目的开发生命周期

  3. 所属分类：Java

    • 发布日期：2008-05-18
    • 文件大小：7340032
    • 提供者：KeyrraTuff

  1. De Novo Peptide Sequencing via Tandem Mass Spectrometry（中文）

  2. 通过串联质谱技术进行多肽测序是蛋白质组学领域中蛋白质识别最强有力的工具之一。因为完整的基因组序列正在迅速地积聚，串联质谱光谱解释的最近趋势早已是数据库搜索。然而，从头测序串联质谱光谱解释仍然是一个公开的问题，它典型地包含质谱专家手工解释。我们为从头测序解释开发了一种新算法SHERENGA，它可以自动地从任何类型质谱仪产生的一个测试光谱集合中学习碎片离子的类型和强度阈值。测试数据用来构建串联质谱光谱表示图中的最佳路径打分。一个高得分路径的分级列表对应了潜在的多肽序列。SHERENGA在解释未知蛋

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2009-04-22
    • 文件大小：1048576
    • 提供者：supportalg

  1. 高通量测序与大数据分析－农学篇

  2. 测序技术推进科学研究的发展。随着第二代测序技术的迅猛发展，科学界也开始越来越多地应用第二代测序技术来解决生物学问题。比如在基因组水平上对还没有参考序列的物种进行从头测序（de novo sequencing），获得该物种的参考序列，为后续研究和分子育种奠定基础；对有参考序列的物种，进行全基因组重测序（resequencing），在全基因组水平上扫描并检测突变位点，发现个体差异的分子基础。在转录组水平上进行全转录组测序（whole transcr iptome resequencing），从而开

  3. 所属分类：讲义

    • 发布日期：2018-01-25
    • 文件大小：68157440
    • 提供者：licnyyu

  1. 《高通量测序与大数据分析－农学篇》多组学研究.

  2. 测序技术推进科学研究的发展。随着第二代测序技术的迅猛发展，科学界也开始越来越多地应用第二代测序技术来解决生物学问题。比如在基因组水平上对还没有参考序列的物种进行从头测序（de novo sequencing），获得该物种的参考序列，为后续研究和分子育种奠定基础；对有参考序列的物种，进行全基因组重测序（resequencing），在全基因组水平上扫描并检测突变位点，发现个体差异的分子基础。在转录组水平上进行全转录组测序（whole transcr iptome resequencing），从而开

  3. 所属分类：讲义

    • 发布日期：2018-01-25
    • 文件大小：17825792
    • 提供者：licnyyu

  1. 《高通量测序与大数据分析－医学篇》微生物组研究

  2. 测序技术推进科学研究的发展。随着第二代测序技术的迅猛发展，科学界也开始越来越多地应用第二代测序技术来解决生物学问题。比如在基因组水平上对还没有参考序列的物种进行从头测序（de novo sequencing），获得该物种的参考序列，为后续研究和分子育种奠定基础；对有参考序列的物种，进行全基因组重测序（resequencing），在全基因组水平上扫描并检测突变位点，发现个体差异的分子基础。在转录组水平上进行全转录组测序（whole transcr iptome resequencing），从而开

  3. 所属分类：讲义

    • 发布日期：2018-01-25
    • 文件大小：23068672
    • 提供者：licnyyu

  1. MRUniNovo：利用hadoop分布式计算框架进行从头肽测序的有效工具

  2. MRUniNovo：利用hadoop分布式计算框架进行从头肽测序的有效工具

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-20
    • 文件大小：136192
    • 提供者：weixin_38723753

  1. 重复和非重复的从头基因组装配算法

  2. 背景。 与Sanger测序相比，下一代测序平台可产生更短的读数，更深的覆盖范围和更高的通量。 这些短读可以在某些特定的基因组分析之前从头组装。 到目前为止，这些当前的组装机的组装重复件的性能非常差。 结果。 为了解决这个问题，我们提出了一种新的基因组组装算法，即SWA，它具有四个属性：（1）组装重复和非重复； （2）采用新的重叠扩展策略来扩展每个种子； （3）采用滑动窗口滤除排序偏差； （4）提出了一种针对低覆盖率数据集的补偿机制。 在仿真和实际测序数据集中都对SWA进行了评估和验证。 重复组装

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-16
    • 文件大小：1048576
    • 提供者：weixin_38577200

  1. 基于动态重叠的基因组组装新方法

  2. 与Sanger测序相比，下一代测序平台可产生更短的读数，更高的覆盖范围和更高的通量。 这些成本最低的技术可以在一天内运行，从而覆盖大多数物种，包括哺乳动物。 这些仪器之一产生的序列数据由数百万或数十亿的序列读段组成，长度范围从50到150nt。 在开始进一步的基因组分析之前，必须从头开始组装这些短读物。 不幸的是，由于许多原因，基因组组装仍然是一个难题，特别是短读段和比读段更长的复杂重复结构。 最近有很多组装算法和软件，其中大多数算法面对重复时显得无能为力，尤其是对于相同的重复算法，并且在完全相

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-16
    • 文件大小：811008
    • 提供者：weixin_38592502

  1. dragonstar2019-源码

  2. 龙之星2019 该GitHub存储库包含演讲幻灯片以及2019年Dragon Star生物信息学课程的计算练习。 这是一个为期五天的课程，主题为“人类疾病的基因组学”。 课程内容如下： 第一天 疾病研究中的基因组技术：， NGS数据格式和变式调用：， 第二天 短/长读序列数据的比对：， 通过短读/长读测序进行基因组组装：， 第三天 人类疾病中结构变异的检测：， 基因变异的注释和表型驱动的解释：， 第四天 SNP和基于序列的全基因组关联研究（GWAS）：， 稀有变种和从头变种关联研究：， 生

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-15
    • 文件大小：42991616
    • 提供者：weixin_42126865

  1. nu-ngs01:NGS-1数据分析课程-源码

  2. NGS数据分析课程1 讲课 第一天 第1部分| 下一代测序技术 第2部分| BASH 第二天 第1部分| 排序文件格式 第2部分| 第3部分| 第4部分| 和 第三天 第1部分| 序列比对 第2部分| 第3部分| 第四天 第1部分| 从头组装算法 第2部分| 第3部分| 第五天 第1部分| 基于参考的装配 第2部分| 第3部分| 第六天 第1部分| 第2部分|

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-10
    • 文件大小：109051904
    • 提供者：weixin_42113754

  1. 基于新测序技术的比对与组装算法

  2. 针对新型超高通量测序仪Solexa测序仪所产生的测序片段read的比对与组装问题,提出一种短序列比对与组装算法SRMA,采用对参考序列进行hash的方法,将测序片段read分3段快速、准确地定位于参考序列,对不能定位的read采取从头(Denovo)组装的方法进行组装。测试结果表明SRMA算法具有较高的性能和敏感度,以及良好的应用前景。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-22
    • 文件大小：1019904
    • 提供者：weixin_38553431

  1. 硕士论文-源码

  2. miRNA-seq分析：已知和从头开始的miRNA鉴定，差异表达和途径富集分析 介绍 microRNA（miRNA）是一类介于19-22个核苷酸之间的小型非编码RNA，可通过抑制翻译或降解信使RNA（mRNA）来充当大多数蛋白质表达的转录后调节因子。 近年来，越来越多的证据表明miRNA在许多生物学过程的调控中起着至关重要的作用，这有利于miRNA-seq分析的发展。 尽管有相当多的证据支持miRNA在对不同病毒感染的React中的相关作用，但通过大量测序对SARS-CoV-2感染的患者的mi

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-16
    • 文件大小：235520
    • 提供者：weixin_42168555

  1. haptreex：单倍型移相器，用于下一代测序数据-源码

  2. 堆树X HapTree-X是一种计算工具，可以分阶段各种下一代测序数据。 目前，它支持全基因组，全外显子组，10X基因组学和RNA序列数据。 它对RNA-seq数据特别有用，因为它可以利用等位基因失衡来获得更好的相位基因区域。 安装 HapTree-X二进制文件在下可用于Linux和macOS。 建筑 要从头开始构建HapTree-X，您将需要最新版本的和 （通常随LLVM一起提供）。 然后，发出make生成HapTree-X。 生成的二进制文件将位于build/haptreex 。 用法

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-15
    • 文件大小：43008
    • 提供者：weixin_42100971